无处可逃
无处可逃
其实我是很抗拒加班的
不过我估计也逃不过了
不如认真投入,白天搞生物,晚上学东西,投简历。
学校的辅导员还有一些就业消息,准备好。
生物这边由于基础差距太大,而且实践经验还没有,我们所能做的就是利用之前所准备的笔记,一步一步排查自己不懂的东西,查漏补缺,我估计我也不太可能以现在的训练程度参加什么大型战役,就像让该死的暴民上罗马的斗兽场,会输的很惨的。
二是侦察,看看考研这条路有没有希望,虽然口头上还的确是有很多助力,但是如果过不了考试这座大山,一切都没得谈啊。
目前这个课题组做的不是算法,是以数据挖掘为主的内容,目前和单细胞基因测序有很大的关系,目前涉及到很多rna转录组以及染色质共沉淀测序。
似乎逆转录是很重要的一步,因为rna太脆了。利用已经标记好的原料把有用的cdna搞出来(所有cdna都一定是外显子),然后再扩增加强显示能力,用激光或者别的方式在芯片上光谱分析,虽然有些数据由于扩增轮数落后导致质量不太好,但是最终结果会在fastq文件把特别不好的搞掉,能够接受的留下但是标注数据质量信度(A是100%E是80%)。
测序之后最终是要mapping回到原基因的位置的,因为测序的部分都是打碎了,所以要知道位置。除了常见的起始子起始密码子tata盒(算是一种转录标志),其他的对位错误率还是蛮小的。
我们拿到了一张图,就这张图,你就可以看到内含外显的问题,而且可以考虑比如说123成环或者转座的情况,毕竟你能够切割组合,别的序列也可以切割组合呀,我们要做的事就是在转录本中逆转录cdna然后根据情况来确定外显子的情况

其实做测序的目的是去挖掘一个有意义的方向,然后我去研究为什么和怎么搞,在几十个有价值的研究问题当中先选一个有保障的出文章。就比如,我可以通过聚类的方式来给大脑细胞分个类,然后找个有意思的类去研究它的功能或者搞新东西啊。
下午一两点吃完饭后没啥战斗力,然后三点钟着手解决效率损失的问题。本来圣夜以来就没有那种专一的学习任务了,当然为了期末自主学习也是拉长到了一两周搞一科目,现在需要解决这个问题了。
妈的看着看着就睡着了,唉我回家了。
